ضمن سعي مواصلات الإمارات للتوسع في الأعمال والمراكز والمشاريع الجديدة المرتبطة بأنشطة المؤسسة بهدف تعزيز مركزها المالي ودعم خطط المؤسسة الإستراتيجية وتحقيق أهدافها التنموية الطموحة، وتحديث هيكلها التنظيمي ليكون أكثر قدرة على استيعاب التغيرات المستقبلية للمؤسسة وتعزيز قنوات الاتصال فيما بين الوحدات التنظيمية لتسيير الأعمال بانسيابية ووضوح.
فقد تم استحداث سبع دوائر وهي، دائرة الخدمات المساندة، ودائرة الخدمات المؤسسية، ودائرة تطوير الأعمال، ودائرة الخدمات الفنية، ودائرة النقل والتأجير للقطاع الجغرافي (أبوظبي والظفرة والعين)، ودائرة النقل والتأجير للقطاع الجغرافي (دبي والشارقة)، ودائرة النقل والتأجير للقطاع الجغرافي (الإمارات الشمالية).
