يترأس مجلس إدارة مواصلات الإمارات معالي وزير التربية والتعليم، حيث يعتبر المجلس بمثابة السلطة العليا للشركة، ويقوم باقتراح وتحديد الخطط والأهداف الاستراتيجية والتنفيذية والسياسات العامة للشركة، والإشراف على شؤونها المالية واعتماد الميزانية المقترحة للشركة والحساب الختامي لها.
كما يقوم المجلس بوضع الإجراءات الكفيلة بضمان تقيد الشركة بأحكام القانون الأنظمة والتعليمات والقرارات الصادرة، ومتابعة تطبيق نظم وضوابط ومعايير الحوكمة والإدارة الرشيدة وما يرتبط بها من ممارسات الشفافية والإفصاح والنزاهة والرقابة الداخلية والسلوك المهني الصحيح، وتقييم ومتابعة أداء الإدارة التنفيذية مقابل الأهداف والميزانية، والإشراف على تنفيذ اللوائح المالية والإدارية ولوائح الموارد البشرية والصلاحيات المالية والإدارية وفق مستوياتها المختلفة، كما يختص المجلس بالموافقة على الهيكل التنظيمي للشركة وآلية وصلاحيات تعديله وإقرار التعليمات الداخلية.
كما يختص المجلس بالموافقة على مشروعات العقود والاتفاقـيات التي تقرر حقوقاً للشركة أو تُرتـب الـتزامات عليها، ودخولها في تسهيلات مالية مع المصارف لتمويل متطلبات واحتياجات الشركة التشغيلية والرأسمالية، كما يقوم المجلس بتعيين ممثلي الشركة في مجالس إدارات الوحدات التابعة ومتابعة سير عمل تلك الوحدات.
